方舟子说，日本人因为矮小被蔑称为“倭”，不知道他这一说法有何依据？出处何在？

据我所知，倭，倭奴，是古代日本人自我称呼的汉语译音词，没有褒贬之意。
日本人曾经一直使用这个词，并不觉得该词是对他们的蔑称。十世纪，虽然“日本”一词已经通行很久了，日本人还是在用“倭”、“倭奴”。藤原公任编撰了一部诗集，就起名《倭汉朗咏集》，这是日本古代最重要的一部诗集。

“倭”、“倭奴”的污名化，是十五世纪日本浪人入侵中国之后的事。然后，《倭汉朗咏集》改名《和汉朗咏集》。